Le ministère à mi en réserve plusieurs territoires pour la création de futures réserves de biodiversité. Certain de ses territoires sont des réserve en vu de faire des parcs nationaux.

Projets :
- Akumunan
- Albanel-Témiscamie-Otish
- Anneaux-Forestiers
- Baie de Boatswain
- Baie de Boatswain
- Basses collines du lac Guernesé
- Brûlis du lac Frégate
- Buttes du lac aux Sauterelles
- Collines de Brador
- Collines de Muskuchii
- Côte d’Harrington Harbour
- Drumlins du lac Clérac
- Dunes-de-la-Rivière-Attic
- Esker-Mistaouac
- Forêt Piché-Lemoine
- Îles de l’est du Pipmuacan
- Île René-Levasseur
- Karst de Saint-Elzéar
- Lac Berté
- Lac Bright Sand
- Lac des Quinze
- Lac Gensart
- Lac Ménistouc
- Lac Onistagane
- Lac Opasatica
- Lac Pasteur
- Lac Plétipi
- Lac Sabourin
- Lac Saint-Cyr
- Lac Taibi
- Lac Wetetnagami
- Marais du lac Parent
- Massif des lacs Belmont et Magpie
- Monts Groulx
- Opémican
- Paul-Provencher
- Péninsule de Ministikawatin
- Plaine de la Missisicabi
- Plateau-du-Lac-des-Huit-Chutes
- Réservoir Decelles
- Rivière de la Racine de Bouleau
- Ruisseau Niquet
- Seigneurie-du-Triton
- Vallée de la rivière Godbout
- Vallée de la rivière Natashquan
- Waskaganis